Действие в фильме «Агора» происходит в Александрии (Египет), в конце эпохи Римской Империи. Христианство набирает все большую популярность и, опираясь на низы общества, становится политической силой.

В это переломное время живёт математик, философ и астроном по имени Гипатия. Эта женщина имеет большое влияние на умы правителей...

Рабу героини Давусу и ее ученику Оресту эта девушка очень нравится. А она предпочитает науку. Мужчины готовы на всё, чтобы это изменить.

Борьба между язычниками и христианами, а также политическое противостояние заставят героев отречься от прежних истин, многое потерять и многое обрести...